4
จุดเริ่มต้นของการแปลรหัสและตัวนำสารแบบไม่มีเครื่องหมายคั่น
HYC-1979 Lesson 9: Have, Translation, Will
00:00

การแปลรหัสในสิ่งมีชีวิตยุคแรกไม่จำเป็นต้องเริ่มต้นด้วยไรโบโซมที่ประกอบสมบูรณ์แล้ว โมเดลดังกล่าวเสนอว่า ตัวปรับต่ออย่างง่ายคล้าย tRNA สามารถอ่านตัวนำสารได้ด้วยการจับคู่แบบComplementaryและแบบantiparallel โดยมีเงื่อนไขว่าต้องมีตัวช่วยเร่งปฏิกิริยาสำหรับการสร้างพันธะเพปไทด์ รูปร่างของตัวปรับต่อขึ้นอยู่กับสิ่งที่มันบรรทุก: มันจะอยู่ในรูปร่าง รูปร่าง hf เมื่อบรรทุกกรดอะมิโน และอยู่ในรูปร่าง รูปร่าง FH เมื่อบรรทุกสายเพปไทด์ การถ่ายโอนกรดอะมิโนไปยังสายเพปไทด์ที่กำลังelongateจะพลิกตัวปรับต่อจาก hf เป็น FH (ดูรูปที่ 49)

เนื่องจากการจัดเรียงตัวปรับต่อ–ตัวนำสารเป็นแบบantiparallel ข้อความจึงสามารถอ่านออกได้โดยไม่ต้องมีเครื่องมือแปลรหัสที่ซับซ้อน การเลือกรูปแบบเริ่มต้นที่อุดมด้วย GC ถูกกำหนดโดยข้อโต้แย้งสี่ประการ ได้แก่ ความเสถียรของปฏิสัมพันธ์ระหว่างตัวปรับต่อกับตัวนำสาร และความแม่นยำในการจำลองแบบ ซึ่งทั้งสองอย่างสนับสนุนให้เริ่มต้นด้วยคู่ GC และการอ่านแบบไม่มีเครื่องหมายคั่นในการแปลรหัสซึ่งต้องใช้รูปแบบ GC ที่ไม่สมมาตร ดังนั้นรูปแบบตัวนำสารแบบไม่มีเครื่องหมายคั่นจึงเกิดขึ้นจากรูปแบบ GC ที่ไม่สมมาตรซึ่งช่วยให้อ่านได้โดยไม่ต้องมีเครื่องหมายคั่นหรือเครื่องจักรการแปลรหัสที่ซับซ้อน

การจับคู่ตัวปรับต่อ–ตัวนำสารและการพลิกรูปร่าง ตัวปรับต่ออย่างง่ายและรูปแบบ GC ที่ไม่สมมาตรช่วยให้อ่านออกได้โดยไม่ต้องมีเครื่องมือที่ซับซ้อน ตัวนำสาร (อุดมด้วย GC, ไม่สมมาตร, ไม่มีเครื่องหมายคั่น) 5′ 3′ G C G C G G C G C C G C hf — บรรทุกกรดอะมิโน aa กรดอะมิโนที่เชื่อมอยู่ ห่วงแอนติโคดอน hf → FH FH — บรรทุกสายเพปไทด์ สายเพปไทด์ ห่วงแอนติโคดอน การถ่ายโอนกรดอะมิโนไปยังสายเพปไทด์พลิก hf → FH การจับคู่แบบantiparallelระหว่างตัวปรับต่อกับตัวนำสาร 5′ 3′ 3′ 5′ G C G C G G C C G C G C C G การจัดเรียงแบบantiparallelช่วยให้ตัวปรับต่ออย่างง่ายอ่านข้อความได้ การอ่านแบบไม่มีเครื่องหมายคั่น รูปแบบ GC ที่ไม่สมมาตรป้องกัน ความกำกวมของเฟรมที่ทับซ้อนกัน ดังนั้น การอ่านจึงไม่ต้องมีเครื่องหมายคั่น ✓

ประเด็นกลไกสำคัญ

  • ตัวช่วยเร่งปฏิกิริยา ยังคงจำเป็นสำหรับหน้าที่การแปลรหัส แต่การแปลรหัสในยุคแรกอาจใช้ตัวปรับต่ออย่างง่ายแทนไรโบโซมที่สมบูรณ์
  • รูปร่างที่ขึ้นอยู่กับสิ่งที่บรรทุก: รูปร่างของ tRNA ขึ้นอยู่กับว่ามันบรรทุกกรดอะมิโนหรือสายเพปไทด์ การถ่ายโอนจะพลิก hf เป็น FH
  • การจับคู่แบบantiparallel: การจัดเรียงแบบComplementaryระหว่างตัวปรับต่อกับตัวนำสารเป็นแบบantiparallel ช่วยให้อ่านออกได้โดยไม่ต้องมีเครื่องมือที่ซับซ้อน
  • รูปแบบที่อุดมด้วย GC และไม่สมมาตร: ความเสถียรและความแม่นยำในการจำลองแบบสนับสนุน GC; การอ่านแบบไม่มีเครื่องหมายคั่นต้องใช้ GC ที่ไม่สมมาตรเพื่อหลีกเลี่ยงความกำกวมของเฟรมที่ทับซ้อนกัน
ความเชื่อมโยงกับรูปที่ 49
การพลิก hf → FH เกิดขึ้นพร้อมกับการถ่ายโอนกรดอะมิโนไปยังสายเพปไทด์ รูปแบบตัวนำสารแบบantiparallel ที่อุดมด้วย GC และไม่สมมาตรคือสิ่งที่ทำให้การอ่านแบบไม่มีเครื่องหมายคั่นเป็นไปได้ก่อนที่ไรโบโซมสมัยใหม่จะเกิดขึ้น